Salah satu program pembiasaan pada MIN 1 Batam adalah kegiatan Pramuka sebelum pembelajaran di mulai. Pembiasaan Pramuka ini dilaksanakan setiap Sabtu pagi, pukul 07.00 WIB.
Seluruh peserta didik dan guru MIN 1 Batam laksanakan kegiatan rutin senam selasa pagi di halaman madrasah yang dimulai pada pukul 07.00 WIB. Senam pagi merupakan suatu aktifitas fisik yang perlu diadakan untuk menjaga kebugaran jasmani para peserta didik.
Setiap hari senin, Madrasah Ibtidaiyah Negeri (MIN) 1 Batam melaksanakan kegiatan rutin yaitu Upacara Pengibaran Bendera. Kegiatan ini di laksanakan pada pagi hari sebelum Kegiatan Belajar Mangajar (KBM) di mulai.
MIN 1 Batam menggelar kegiatan makan sehat bersama untuk siswa. Seluruh siswa yang terdiri dari 860 orang hadir dalam kegiatan yang dilaksanakan pada Jum’at pagi setelah kegiatan Muhadharah.
MIN 1 Batam melaksanakan kegiatan muhadharah yang diikuti peserta didik di halaman sekolah, Jumat (26/1) pagi. Kagiatan Muhadharah merupakan salah satu bentuk program pembiasaan yang cukup efektif untuk melatih keberanian dan keterampilan siswa.
Siswa-siswi kelas 4 menggelar kegiatan Projek Penguatan Profil Pelajar Pancasila dan Rahmatan Lil 'Alamin (P5PPRA) Fase B dengan Tema: "Gaya hidup berkelanjutan mengurangi sampah plastik dan memilah sampah organik dan anorganik"
